3章.载体总结剖析_载体工作总结

其他工作总结 时间:2020-02-28 03:18:18 收藏本文下载本文
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3章.载体总结剖析由刀豆文库小编整理,希望给你工作、学习、生活带来方便,猜你可能喜欢“载体工作总结”。

·作为一个理想的载体,应具备以下条件: 1.具有对受体细胞的可转移性

2.具有与特定受体细胞相适应的复制位点或整合位点 3.具有多种单一的核酸酶切位点 4.具有合适的选择标记

5.具有较好的安全性,不能任意转移 6.具有较高的外源DNA的载装能力

·克隆载体(cloning vector):主要是对目的基因克隆,建立DNA文库和cDNA文库,其上有复制子即可;

·表达载体(expreion vector):能使目的基因在宿主细胞中表达的一类载体。这类载体既有复制子,更要有强启动子; ·穿梭载体(shuttle vector):这类载体可以在原核细胞中复制,也可在真核细胞中扩增和表达。

·细菌质粒(plasmid)包括三种组成部分:

复制必须区、选择标记基因、限制性核酸内切酶的酶切位点(克隆位点,MCS).·质粒DNA分子具有三种构型:

超螺旋共价闭环DNA,cccDNA,SC构型

开环DNA,ocDNA,OC构型

线性DNA,cDNA,L构型

·严紧型和松驰型质粒

严紧型质粒:在宿主细胞中的拷贝数较少,一般只有1~3个

松驰型质粒:其拷贝数较多,一般20~60个,多的可达200~300个

·转移型和非转移型质粒

转移型,结合型(conjugative plasmid)是指一些质粒在不同的菌株中可以相互转移

非转移型质粒(non-conjugative plasmid)则只能在一种寄主中生存(常用于构建克隆载体)

·质粒的不相容性

任何两种含有相似复制子结构的不同质粒,不能同时存在于一个细胞中,这种现象称为质粒的不相容性。

·人工组建的质粒的第一个字母是质粒英文名字(plasmid)的第一个字符p,用小写。p后有2个字母是大写,表示质粒的作者和实验室名称,再其后为质粒的编号。

·实验室一般使用下列三种方法制备质粒DNA:

①氯化铯密度梯度离心法:质粒DNA纯度高、周期长、设备要求高、溴乙锭污染; ②碱裂解法(最常用):质粒DNA纯度、操作周期介于氯化铯法和沸水浴法之间; ③沸水浴法:质粒DNA纯度底、快速、操作简便。

1.pSC101质粒载体

结构:编码一个四环素抗性基因(Tetr);有多个单一的酶切位点。

特点:严紧型低拷贝质粒,每个细胞仅有1~2个拷贝,所以DNA产量低;插入3个位点,Tetr会失活;具有可插入外源DNA的EcoRⅠ单克隆位点,且不影响其功能。2.ColE1质粒载体

优点:①能产生大肠埃细菌素,还编码使宿住细胞对大肠埃细菌素E1免疫性的基因

②有EcoRⅠ的单一切割位点

③松弛型复制子,几乎是所有人工质粒的组成元件

缺点:以大肠埃细菌素免疫性作为选择标记的体系存在较大的缺陷 3.pBR322质粒载体(应用最广)

组成:①来自pSCl01的四环素抗性基因Tetr

②来自ColEl的衍生物pMBl的松弛复制起点ori

③来自pSF2124的氨苄青霉素抗性基因Ampr 特点:①具有较小的分子量(4363bp)

②具有两种抗菌素抗性基因可供作转化子的选择记号

③利用ColEl的复制子在细胞中是多拷贝的,可通过氯霉素使质粒拷贝数进一步扩增 缺点:pBR322质粒上的EcoRⅠ位点不会发生插入失活,而EcoRⅠ酶又是基因工程中最常

用的一种核酸内切限制酶

4.pUC质粒载体

·在pBR322质粒载体的基础上,加入了一个在其5’端带有多克隆位点的LacZ'基因。组成:①来自于pBR322的Ori(复制起点)

r

②氨苄青霉素的抗性基因(Amp),但核苷酸序列发生了变化

③ LacZ′基因,编码β—半乳糖酶的α—肽链即氨基末端

④位于LacZ′基因的靠近5’端的一段MCS区段,但不破坏该基因的功能 ·与pBR322相比,pUC质粒载体优点: ①具有更小的分子量和更高的拷贝数

②适用于组织化学法检测重组体(通过α-互补作用,利用菌落颜色筛选重组子)③具有多克隆位点区段(MCS),可以定向克隆防止载体自我连接。·β-半乳糖苷酶筛选系统

载体上带有一个来自大肠杆菌的Lac操纵子的DNA区段,这一区段编码β-半乳糖苷酶氨基端的一个蛋白片段。IPTG可以诱导该片段的合成,而该片段能与宿主细胞所编码的β-半乳糖苷酶羧基端的一个蛋白片段互补(α-互补)。故暴露于诱导物IPTG的细菌与含有编码LacZ’的质粒可同时合成该酶的两种片段,该菌在其生色底物X-gal的培养基上生长,将形成蓝色菌落。5.TA克隆载体

在PCR中,TaqDNA聚合酶在可PCR产物的3’端加上一个非配对的脱氧腺嘌呤核苷(A),而研制出的线性质粒,其5’端各带有一个不配对脱氧胸腺嘧啶核苷(T)。

·穿梭质粒载体 人工构建的、具有两种不同复制起点和选择标记、可以在两种不同的寄主细胞中存活和复制的质粒载体。

优点:① 利用大肠杆菌进行基因克隆、表达;

② 也能利用其它细胞系统(酵母、枯草杆菌、哺乳动物细胞等)进行基因表达; ③ 可以自如地在两种不同寄主细胞之间来回转移基因。·噬菌体的生活周期

①溶菌周期:烈性噬菌体感染细菌后,立即在菌体内复制DNA和合成外壳蛋白质,重新组装成噬菌体颗粒,并导致细菌细胞解体,释放出大量子代噬菌体。②溶源周期:温和噬菌体感染细菌后,将自己的DNA整合到细菌的染色体DNA中, 这一过程称为溶源化。整合到细菌染色体上的噬菌体DNA称为原噬菌体,随细菌的染色体复制而复制。-现知道只有双链DNA的噬菌体才具有溶源周期。

·溶源周期的主要特征

-λ噬菌体:噬菌体的DNA分子注入细菌细胞,经过短暂的转录之后,需要合成一种整合酶,于是转录活性便被一种阻遏物所关闭,噬菌体分子的DNA分子插入到细菌染色体基因组DNA上,变成原噬菌体,细菌继续生长、增殖,噬菌体的基因作为细菌染色体的一部分进行复制。-P1噬菌体:不存在噬菌体DNA分子的整合作用体系,而是变成了一种进行独立复制的环形的质粒DNA分子。

·λ噬菌体

-λ噬菌体是大肠杆菌的温和型噬菌体-λ噬菌体由外壳包装蛋白和λ-DNA组成-λDNA在噬菌体中是线状双链DNA分子,60多个基因,其中有1/3的区域是其裂解性生长 的非必需区,这一区段的缺失,或在此区段中插入外源DNA,并不影响噬菌体的增殖,这

就是λ噬菌体可作为基因载体的依据

·λDNA分子的特点 ①长度为48502 bp ②双链线性DNA ③但在两端有cos位点,可以环化

-λcos位点:λDNA两端各有12bp的粘性末端,粘性末端形成的双链区域称为λcos位点

·λDNA复制

早期:一个复制子,双向复制,θ型复制

晚期:滚环复制,多个λDNA分子形成线状多联体

·选用λ噬菌体作为构建克隆载体材料的依据 ①λ噬菌体是一种温和噬菌体 ②能承载比较大的外源DNA片段

③λDNA分子上有多种限制性核酸内切酶识别位点,便于多种外源DNA酶切片段的克隆

·λ噬菌体的缺点 ①基因组太大 ②酶切点太多。(有5个BamH1位点、5个EcoRⅠ位点、6个BgⅠ位点)③野生型只能接纳一定长度的外源DNA

·λDNA载体适合克隆和扩增外源DNA片段,但不适合表达外源基因。

·构建λ噬菌体克隆载体的基本策略

-用限制性核酸内切酶切去λDNA上的非必需区-抹去多余的限制性内切酶切割位点

-在λDNA的非必需区内插入选择标记基因(其重组噬菌体DNA大小只能是38kb-52kb)-建立λDNA分子体外包装系统

·λ噬菌体载体的类型

-插入型载体:只能承受较小分子量(一般在10kb以内)的外源DNA片段的插入,广泛应用

于cDNA及小片段DNA的克隆。

只有1~2种限制性核酸内切酶的单一切割位点;大肠杆菌β-半乳糖苷酶失活-置换型载体:在其中央部位有一个可以被外源插入的DNA分子取代的DNA片段的克隆载体,可承受较大分子量的外源DNA片段的插入,适用于克隆高等真核生物的染色体DNA。-凯伦噬菌体载体:既有插入型也有替换型。

·cosmid质粒载体:是一类(由人工构建的)含有λ噬菌体DNA的cos序列和质粒复制子的特殊类型的质粒载体。用于克隆大片段DNA的载体。

·cosmid 质粒的特点

①具有λ噬菌体的特性:在寄主细胞内形成环化DNA(但不能形成新的噬菌体颗粒而溶菌,即不能体内包装)。克隆外源DNA后可以体外包装成噬菌体颗粒。

②具有质粒载体的特性:大多带有pMB1或ColE1的复制子,能像质粒一样复制。③方便的选择:有抗菌素抗性基因,和插入失活的克隆位点。④高容量的克隆能力:45kb(最少不能低于30kb)。

·M13噬菌体载体(单链DNA噬菌体)①+DNA。(DNA)

②复制型(RF)是双链环状DNA。

③RF-DNA和DNA都能转染感受态 大肠杆菌。并产生噬菌斑。④不存在包装限制。

⑤可产生大量的含有外源DNA插入片段的单链分子,便于作探针或测序。

·M13系列载体的优点:

①有MCS,便于克隆不同的酶切片段。②X-gal显色反应,可供直接选择。③无包装限制,克隆能力大。

④可以克隆双链DNA分子中的每一条链(子代M13噬菌体中包含的是单连+DNA)。

·M13载体的缺点:

①插入外源DNA后,遗传稳定性显著下降。

②实际克隆能力小于1500bp(虽无包装限制,并非无限包装)。

·M13的生活周期

·噬菌粒载体

是一类由质粒载体和单链噬菌体载体结合而成的新型的载体系列。(人工构建)

·噬菌粒具有以下特征

①双链 DNA 既稳定,又高产,具有常规质粒的特征;

②免却了将外源 DNA 片段从质粒亚克隆于噬菌体载体这一既繁琐又费时的步骤; ③由于载体足够小,故可得到长达 10kb 的外源 DNA 区段的单链;

④两种复制形式:既具有质粒的复制起点,又具有噬菌体的复制起点。因此,既能在大肠杆菌中以质粒的形式双链复制,又能在噬菌体内进行单链复制。

·噬菌粒的主要优点在于它可以产生大段外源 DNA 的适量单链拷贝,又不必担心发生缺失突变,而这些外源 DNA 区段常常由于太大而不能克隆于常规 M13 载体。但许多噬菌粒都有一个主要缺点,即辅助噬菌体感染后,有时候单链 DNA 的产量较低且重复性较差。

·PCR产物克隆载体---T载体

-Invitrogen公司开发的线性噬菌粒载体。由pUC的质粒部分、fi噬菌体ori、Kanr和Ampr抗性构成。

-突出特点是MCS的中部已经切开,各有一个5’端突出的T。因PCR产物往往在3’端突出一个A,所以能与这个载体直接连接。

·人工染色体载体

人工染色体实际上是一种“穿梭”克隆载体:含有质粒克隆载体所必备的第一受体(大肠杆菌)源质粒复制起始位点(ori),还含有第二受体(如酵母菌)染色体DNA着丝点、端粒和复制起始位点的序列,以及合适的选择标记基因。

·第一受体的克隆子一般采用抗菌素抗性选择标记,而筛选第二受体的克隆子常用与受体互补的营养缺陷型。-酵母人工染色体(YAC):200-500kb,主要用于基因文库构建——克隆大型基因簇(gene cluster)结构&构建动植物基因文库-细菌人工染色体(BAC):50-300kb,主要用于基因文库构建——易于发生重组、缺乏稳定性、制备工艺繁琐

-哺乳动物人工染色体(MAC):大于1000kb,基因治疗

·基本构件:复制起点、端粒、着丝粒

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