Qiagen80004 抽提RNA、蛋白和DNA由刀豆文库小编整理,希望给你工作、学习、生活带来方便,猜你可能喜欢“蛋白质和dna提取”。
实验目的:白三烯受体mRNA的表达
实验方法:(半)定量聚合酶联反应
实验步骤:
一、抽提RNA
实验器具和材料
1,实验器具与材料:
(1)移液枪:1ml、200ul、10ul(2)吸头:1ml、200ul、20ul(3)吸头台:放置1ml吸头的一个,放置200ul和20ul的吸头一个(4)EP管1.5ml、2ml、200ul、10ul(5)电动匀浆器(6)50ml离心管
(7)饭盒
(8)冰盒
碎冰
(9)酒精纱布,供清洁桌面和试管架等。
2, 实验器具的处理与准备
(1)金属制品:(镊子等)提前确定组织的重量,如果组织需要分割,还需要一个刀片。先洗干净,再送干烤3次。(不需要泡DEPC水)
3,试剂配制和准备:
(1)DEPC水:直接购买配置好的。DEPC剧毒,购买那些已经高温高压处理去除DEPC的水。
(2)配70%乙醇:用DEPC水和无水乙醇按照3:7的比例配置。实际上,用超纯水配置也可以,因为70%乙醇用来提取蛋白,不涉及RNA降解的问题。(3)无水乙醇(4)
β-ME(5)
DTT
(6)Buffer RLT、buffer ALO、Buffer RPE、buffer AW1、buffer AW2、Buffer EB
准备工作:
1.在每 1 ml Buffer RLT 中加入10 ul β-ME(加入β-ME的Buffer RLT可在室温下放置1月)。根据实验需要吸取Buffer RLT,不要把 β-ME加到瓶子里。2.每1ml buffer ALO中加入8mg DTT。根据实验需要吸取Buffer ALO。
3.Buffer RPE、buffer AW1、buffer AW2中加入一定体积的无水乙醇。瓶盖上打钩说明已加入无水乙醇,如果没有打钩,需要加入无水乙醇。
4.buffer RLT可能会有沉淀,必要时可适当加热使其溶解,在室温中保存。5.预热Buffer EB至70℃(此步骤适用于抽提DNA)。
实验步骤: 样本研磨和匀浆。
1.取组织:30mg、在干净的表面、速度要快。(根据组织重量决定buffer RLT和其他试剂的用量)
2.研磨组织,在600ul buffer RLT中匀浆化:电动匀浆器。冰上操作。
3.最大速度离心溶解产物3分钟。用吸量管将上层清液转入放置着Allprep DNA spin column的2ml收集管(紫色柱子)中。轻轻盖上盖子,8000×g(or 10000rpm)离心30s。注意:有时,在3分钟离心后还存在着少量的未溶解的物质,要使这些不可见;确定离心后没有液体残留在column membrane,必要时可重复离心直到液体都通过膜。
4.将Allprep DNA spin column 放在一个新的2ml收集管中,并且在室温中保存或者在4℃为了之后的DNA提纯。在后面的RNA提纯使用流出液。
注意:不要在室温或者4℃情况下保存Allprep DNA spin column太长时间。不要冰冻柱子。
RNA提纯
5.在刚才第4步的流出液中加入430ul无水乙醇:250ul(buffer RLT 350ul)或者430ul(buffer RLT 600ul)。用吸量管充分混合。勿离心,马上进入第6步。
注意:若匀浆的液体有所丢失,相应地减少无水乙醇的量。这步可能会产生沉淀物,但是并不影响之后的过程。
6.将样本(约700ul,包括可能形成的沉淀)加入到RNeasy spin column中(粉色柱子,放在一个2ml的收集管中),轻轻盖上管盖,8000×g(or 10000rpm)离心15s。为了之后的蛋白提纯,将流出液转移到一个2ml 的管子中。
注意:该收集管可在第7步中再使用。如果样本量超过700ul,再离心。
7.将700ul buffer RW1 加入RNeasy spin column(粉色柱子)中。轻轻盖上管盖,8000×g(or 10000rpm)离心15s。弃掉流出液。收集管继续使用。
注意:在离心后,小心转移RNeasy spin column,以避免column接触到流出液。确定将收集管中是完全空的。
8.将500ul buffer RPE 加入RNeasy spin column中。轻轻盖上盖子,8000×g(or 10000rpm)离心15s,弃掉流出液,收集管再用。
9.将500ul buffer RPE 加入RNeasy spin column中。轻轻盖上试管8000×g(or 10000rpm)离心2min。(此次长时间的离心可以使柱子的膜干燥,以保证在RNA洗脱过程中没有乙醇残留。)
注意:在离心后,小心转移RNeasy spin column,以避免柱子接触到流出液。
10.可选:将RNeasy spin column转到一个新的2ml收集管中,并且弃掉旧的含有流出液的收集管。最大速度离心1分钟。
11.将RNeasy spin column转到一个新的1.5ml收集管中。直接将30-50ul的Rnase-free water加入柱子的膜中。轻轻盖上盖子,8000×g(or 10000rpm)离心1min以洗脱RNA。
12.如果预期的RNA产生大于30ug,可以另外再用30-50ul的Rnase-free water重复上一步的操作,或者如果需要高浓度RNA就直接使用上一步的洗出液。上一步的收集管继续使用。提取的RNA:-80℃冻存,但最好直接逆转录成DNA。
蛋白沉淀
13.在第6步的流出液中加入1倍体积(通常600ul or 1000ul)的buffer APP。用力混匀并在室温中静置10分钟以使蛋白沉淀。
14.最大速度离心10分钟,用枪小心吸掉上层清液。
15.在蛋白颗粒中加入500ul 70%的乙醇,最大速度离心1分钟,用枪小心移除上层清液。
16.在室温下吹干蛋白颗粒,大约5至10分钟。
17.加入100ul buffer ALO,并用力混匀以使蛋白颗粒溶解。
18.在95℃下静置5分钟以使蛋白完全溶解及变性。随后冷却样本。
19.最大速度离心1分钟。上层-20℃保存,western用;沉淀-20℃保存,备用。
DNA提纯
20.往之前第4步中的Allprep DNA spin column加入500ul buffer AW1,轻轻盖上管盖,8000×g(or 10000rpm)离心15s。弃掉流出液。Spin column继续使用。
21.往Allprep DNA spin column加入500ul buffer AW2,轻轻盖上管盖,最大速度离心2min。
注意:在离心后,小心从收集管中移出Allprep DNA spin column。如果柱子中含有流出液,倒空收集管并再以最大速度离心1分钟。
22.将Allprep DNA spin column放置到一个新的1.5ml收集管中。直接将100ul buffer EB 加入spin column membrane并关上盖子。在室温中静置2分钟,然后 8000×g(or 10000rpm)离心1min以洗脱DNA。
23.重复上一步。
注意:使用新的1.5ml收集管来收集第二次的DNA洗出液。重复使用上一步的收集管使两次洗出液混合。
AllPrep DNA/RNA/Protein Mini Kit可从同一细胞或组织样本中同时纯化基因组DNA、总RNA和总蛋白质,使样本制备流程流畅高效(参见流程图“AllPrep DNA/RNA/Protein procedure”)。使用此试剂盒无需在纯化前将样本分为三份,因此DNA、RNA和蛋白质的回收水平达到最高。此外,纯化过程中无需使用酚和丙酮等有机溶剂。细胞或组织样本首先在Buffer RLT中裂解,使得DNA酶、RNA酶和蛋白酶立刻失活,确保可分离得到完整的DNA、RNA和蛋白质。用AllPrep DNA离心柱过滤裂解液。使用该离心柱和高盐缓冲液可高效的选择性结合基因组DNA。洗脱之后即可得到即用型DNA。
在AllPrep DNA离心柱的流出液中加入乙醇,形成适合RNA结合的条件。用RNeasy离心柱过滤样本,总RNA与膜结合,污染物被去除。然后用不含RNA酶的纯水进行洗脱,得到高品质RNA。
Buffer APP是新型的水溶性蛋白沉淀溶液。将其加入RNeasy离心柱的流出液中,然后离心得到蛋白质沉淀。用适合的溶液溶解完整的总蛋白质,即可直接用于下游应用。此试剂盒包括Buffer ALO,该缓冲液用于溶解蛋白沉淀,不影响SDS-PAGE操作。
应用
AllPrep DNA/RNA/Protein Mini Kit标准化了系统生物学研究中的样本制备过程。DNA、RNA和蛋白质为同一来源,减少了从不同样本中制备这些分析物时引起的内在差异。