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蛋白质化学思考题总汇 绪论
基因组，蛋白质组，功能基因组
为什么从基因组到蛋白质组是一个十分复杂而漫长的过程？
蛋白质一级结构
1、各种氨基酸的三字母符合和单字母符合。
2、名词概念：同源蛋白质、趋异突变、趋同、变异、蛋白质家族、蛋白质超家族、蛋白质、亚家族、单位进化周期、中性突变、蛋白质的一级结构。
3、各种氨基酸的性质与蛋白质空间结构的关系.蛋白质的空间结构
1、名词及符号：蛋白质构象、蛋白质二级结构、超二级结构、三级结构、四级结构、结构域、连接条带、无规卷曲、无序结构、α-螺旋、β-折叠、β-转角、EF-手、3.613螺旋、HTH、HLH、b-Zip、motif、Zn指、domain、2、稳定球蛋白构象有哪些的化学键.3、二级结构的类型有哪些？
4、举例说明5种motif的结构特征。蛋白质的分离纯化
1.透析、超滤、盐溶、盐析、亲和层析、电泳。2.如何理解分子筛分离pr的原理。3.有机溶剂分级分离pr的基本原理。
4.据支持物不同，电泳可分为哪几种类型？ 5.常用的选择性吸附剂有哪几种？
6.哪些物质可作用蛋白质亲和层析的配体？ 7.测定pr分子量有哪些方法？
8.如何理解蛋白质电泳中的浓缩效应，电荷效应及分子筛效应。9.聚焦法测定pr、pI的基本原理。
10.可用哪些方法来分要蛋白质的N-末端和C-末端AA。蛋白质转运和修饰
1、名词及符号：翻译同步转运、翻译后转运、信号肽、易位子、SRP、I、II型膜蛋白、内部信号序列、分子伴侣、hsp70、内体、靶向序列、靶向班块、网格蛋白、包被体、停靠蛋白、PDI、ARF、COP、内质网分拣信号（KDEL）、核定位信号（PKKKRKV）、过氧化体分拣信号（SKF）、线粒体基质信号（N-端15-35AA形成两亲a螺旋或b折叠）、溶酶体分拣信号（M6P）、泛蛋白。
2、蛋白质的修饰包括哪些内容。
3、决定蛋白质半衰期的因素及泛素化作用。
4、受体介导的内化的生物学意义。
5、简述翻译同步转运和翻译后转运的基本内容。
6、如何理解小泡介导的蛋白质转运的“生物膜不对称性”的意义。
7、简述SRP介导的蛋白质转运。免疫球蛋白
1、Ig, V区，C区，抗原决定族，D基因，J基因，超变区(补体决定区，CDR),类别转换(CH启换)，12－23bp规则，茎环结构，Fab,Fc,去环缺失模式，Ig的分类与重链。
2、描述Ig四链单位的分子特征(结构域，功能域)。
3、如何根据Ig分子的V区和C区的结构变化，将Ig分子的变异体分成类、亚类、型、亚型、群和亚群。
4、如何从基因水平上解释Ig的多样性。脂蛋白
1、名词及符号：
LP,Apo,TG,FC,PL,CM,VLDL,LDL,HDL,IDL,HL,LPL,LCAT,LTP;郭清作用，增加调节。
2、简述一种脂蛋白受体的分子结构特征。
3、主要脂蛋白的密度分类、电泳分类、功能及缩写符号间的关系。
4、Apo可分哪些大类。
5、CM,VLDL,LDL,HDL代谢的基本情况及其相互关系 细胞黏附分子
1、名词及符号：ECM、Fn、Ln、FAK、TPK、SH、Ln-R、CD44，Ig-SF；血管地址素、整联蛋白、层连蛋白、钙粘蛋白、粘着班激酶、酪氨酸蛋白激酶、纤连蛋白。
2、简述细胞外基质粘附分子的功能。
3、细胞表面粘附分子(如整联蛋白、层连蛋白受体、钙粘蛋白等)有哪些可能的功能。细胞骨架蛋白
细胞骨架蛋白：细胞质中由蛋白丝组成的非膜相结构统的蛋白质
细胞骨架系统：微丝、微管和中间丝 还包括核骨架、核纤层、细胞外基质细胞骨架的主要蛋白质：肌动蛋白（肌动蛋白相关蛋白），微管蛋白（微管
相关蛋白），中丝间蛋白（各种中间丝相关蛋白）。
加帽蛋白：选择性阻断F-肌动蛋白微丝的一端.如倒刺端加帽蛋白会造成微丝缩短，而
尖端加帽蛋白会造成微丝的延长
肌球蛋白：属于马达蛋白，由两个重链和2个轻链组成肌球蛋白分子，两个分子尾部相
连，缔合形成粗丝双极性结构，球形的头部具有ATP酶活性
肌球蛋白和肌动蛋白有什么功能？？肌肉收缩，细胞结构，细胞运动，细胞分裂，细胞株凋亡，细胞器的转运
马达蛋白的功能：驱动蛋白和动力蛋白！真核细胞含有三种主要的马达蛋白家族:肌球蛋白,kinesins蛋白,动力蛋白,初一看,这些蛋白家族好像彼此很不同.在肌肉中的肌球蛋白,开始时被描绘成有它自己的作用基础,沿着肌纤蛋白的丝运动,肌肉肌球蛋白包括两个拷贝,它们都有一个87kd分子团的重链,一个必需的轻链,和一个起调节作用的轻链.人类基因似乎能编码超过40种截然不同的肌球蛋白,在肌肉收缩中有些功能和另一些参与不同种类的其他过程.kinesins蛋白在蛋白质,囊泡和沿微管的细胞器转运中起作用,包括染色体分离,kinesins蛋白常包括两个拷贝,一个是重链,一个是轻链,它的重链大约只有肌球蛋白长度的一半,人类基因至少能编码40种kinesins蛋白.在一些真核细胞中,动力蛋白能驱动纤毛和鞭毛的运动,和其他作用蛋白相比,动力蛋白较大,有个大于500kd的分子团重链,人类基因似乎能编码大约10种动力蛋白.比较肌球蛋白，kinesins和动力蛋白的氨基酸序列，并没有出现这些蛋白质家族之间有意义的关系，但是，在确定它们的三维结构之后，肌球蛋白和kinesins家族的成员之间被发现有显著的相似性，特别是，肌球蛋白和kinesins都包含同源的P-环NTP酶核心部位，这些在G蛋白中也存在。动力蛋白重链的序列分析揭示出它是P-环NTP酶的AAA子家族的一个成员，我们以前在19S 蛋白解体系统中遇到过该子家族，动力蛋白有6个序列编码一个沿着它的长段排列的P-环NTP酶整环。从而，可以利用有关G蛋白和其他P-环NTP酶的知识来分析这些马达蛋白的运动机理。！
细胞因子
1、名词及符号：PDGF、CSF、HGF、EPO、EGF、INF、TGF、NGF、IL、TNF、FGF、IGF、TPK；自分泌、旁分泌、内分泌、细胞内分泌、细胞因子、自磷酸化、重叠性、协调性、多功能性。
2、细胞因子(Cystokine)有哪些分类方法，各自的分类依据是什么？
3、简述细胞因子的结构和功能特点。
4、简述细胞因子受体结构的共同特征和功能特点激素与信号转导
1、名词及符号
外激素、激素受体、下降调节（增加上升调节）、激素正协同效应、激素对抗、效应器、5-HT、ADH、LRH、FRH、TRH、CRH、OT、CRIH、AMP、AC、HCG、LH、FSH、CCK、PMCG、TSH、E2、P4、T、F、MSH、GH、PL（PRL）、ACTH、PG、CT、PTH、MRIH、MRH、PRH、PRIH、GRIH、GRH。
2、哪些器官可以分泌H？据化学本质、H素可分哪几类？
3、受体分几类？胞内和胞膜受体的作用机理。
4、神经体液调节的基本模式。
糖蛋白和蛋白多糖
1、名词及符号：Gal、Glc、GalNAc、Fuc、SA、Man、Dol、GAG、HA、CS、KS、HS：糖蛋白，蛋白多糖、戊糖核心、高Man型、杂合型、复合型、还原末端、非还原末端、天线、糖型（同一Pr.不同NXS/T上的N-聚糖结构不同）。
2、比较O－聚糖和N-聚糖的差异。
3、ABO血型的分子差异（H-A；GalNAc-T;H-B;Gal-T）
4、O-糖基化和N-糖基化位点的结构特征。
5、简述N-糖合成与成熟的部位及特点（Dol,糖基转移，cis,中间，外侧高尔基体，糖苷酶，糖基转移酶）
蛋白质生物合成与调控
Kozak序列，帽子结合蛋白，小亚基需扫描，AUUUA序列（与mRNA的稳定性相关），翻译绕过，反式翻译（避免核糖体阻滞在异常mRNA上，加速核糖体再循环，翻译出异常多肽链的C端标记，便于被识别和降解）
mRNA翻译中的重编码：移码，密码子意义重定义（redefine），翻译中模板的不连续性 原核与真核生物蛋白质生物合成的差异？
在真核细胞，有效的起始依赖于围绕在起始密码子ATG上下游的一段叫Kozak序列的序列。
