进化分析步骤_进化树分析步骤

其他范文 时间:2020-02-26 20:46:12 收藏本文下载本文
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1)BioXM2.6 查找前后引物,去掉载体序列,进行BLAST下载Genbank中的同源

序列,整理成.txt文档。BioEdit 对序列进行剪切编辑。

2)ClustalX 软件载入序列,进行完全比对/MEGA5 软件导入序列,进行ClustalW

序列比对,保存.max文件。

3)MEGA5比对结束后,查找最适宜的进化树分析方法,J&C、T92 or T93+G,选

择合适的方式进行建树。ML/NJ,设定 boottrap 500/1000。

4)

5)

MEGA5图片初步处理,调整次级分支的位置,保存为.nex/.tree/.txt文件 用Dendroscope图像处理软件打开.nexus/.nexml进行图片编辑。

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