生物科学专业信息资源推介由刀豆文库小编整理,希望给你工作、学习、生活带来方便,猜你可能喜欢“生物科学专业介绍”。
生物科学专业信息资源推介
数据库名称BGI家蚕基因组数据库 BGISilkworm Database数据库网址数据库简介KRGD是韩国大米的基因数据库,它搜集有关韩国大米的所有基因。数据库提供的EST序列查找能够快速找到所要研究的基因的EST。数据库还提供韩国大米的基因图谱,帮助相对准确地在基因组染色体上找到基因的定位。KRGD目前由韩国Myongji大学的生物科学系负责维护管理。服务方式:查询、免费下载。关键字Korea 韩国rice大米genome 基因组数据库名称线虫基因组数据库AceDB数据库网址http://www.daodoc.comRITBA、GBF、GSF、Medical Resource Council、ISREC、UNIL合作,旨在提供一种用特殊区域来阐释基因组DNA序列的工具。由于全基因组扫描使得数据量骤增,对这些序列的系统功能分析被对基因产物的结构功能分析取代。该数据库收集了序列分析的相关数据,并适当整合,用数学公式精确描述,对启动子、增强子、LCR和编码区、开放阅读框的关联作广泛分析,所有的数学公式用适当的模式基因组修正。服务方式:查询、分析、免费下载。关键字tool工具genome 基因组数据库名称小鼠基因组信息数据库 The Mouse Genome Database数据库网址http://www.daodoc.com/数据库简介小鼠基因组信息数据库由美国著名的杰克森实验室创建,提供了针对实验室小鼠的遗传学、基因组学和生物学数据的综合检索。该数据库提供了多种检索工具,如针对序列的小鼠BLAST。该数据库分类详细,用户可以根据所需选择适当的分类检索,如基因和标记、等位基因和表型、株系和多态性、基因表达、图谱、小鼠肿瘤生物学、探针和克隆以及参考文献等。该数据库允许用户按分类列表提交新的数据,同时也提供相关的数据下载服务。服务方式:查询。关键字mouse小鼠genome 基因组数据库名称整合鼠基因及基因组数据库 The Rat Genome Database数据库网址http://rgd.mcw.edu/数据库简介由威斯康星医学院和NIH血液中心创建,鼠基因及基因组的研究机构合作维护,旨在收集、巩固和整合鼠基因及基因组的研究成果,使之能尽快被科研机构取得,并提供数量显著位点、突变和其他表型数据,每月1日、15日更新。是目前全世界重要的鼠研究合作机构,有研究论坛和ftp下载。数据包括基因序列、QTL、SSLP、EST、家系、图谱等。可用的工具有BLAT、BLAST、基因注释、基因组扫描等。目前,日本和中国都有其镜像站点。服务方式:查询、分析、免费下载。关键字mouse小鼠genome 基因组中国生物工程杂志China Biotechnology, 2005, 25(11):98~103
研发动态
北京蛋白质组研究中心正式成立北京蛋白质组研究中心日前在中关村生命科学园成立,该中心同时也是人类肝脏蛋白质组计划的国际总部。
人类肝脏蛋白质组计划旨在寻找解析与人类肝脏重大疾病和生理功能相关的蛋白质。军事医学科学院副院长、北京蛋白质组研究中心主任贺福初院士介绍,该计划自去年启动以来,已鉴定中国人胎肝蛋白质3 000种,法国人肝脏蛋白质5 000种,中国成人肝脏蛋白质12 000种,并将这些鉴定结果建立了数据库。目前,专家们正对这些数据进行分析。
由我国首先提出并领衔的“人类肝脏蛋白质组计划”是第一个人类组织器官的蛋白质组计划,也是我国科学家首次成为大型国际科研计划的领导者之一。在中国领导下,已有16个国家的80多个实验室参与了研究工作。
在人类基因组研究取得进展后,人类蛋白质组的研究能进一步解析生命现象、致病机理和病理。由于中国肝病人数较多,因此我国决定加大对肝脏蛋白质组的研究力度。对肝脏蛋白质组的研究将作为诊断肝病、新药设计的靶标。2001年诺贝尔医学奖得主利兰·哈特韦尔说,对肿瘤的研究应以早期诊断为主,而中国领导的肝脏蛋白质组研究将有助于肝癌的早期诊断。
中法胚胎细胞生物学
联合实验室成立中国科学院副院长陈竺与来访的法国国家农业研究院院长Marion Guillou女士于11月4日共同签署了创建中法哺乳动物胚胎细胞生物学联合实验室(简称LABIOCEM)的协议。该协议明确了双方学术交流、生物材料交流、谈判和完成研究合同的法定框架及共同准则。双方一致同意在中法双方法律法规允许的范畴内,就双方共同感兴趣的合作项目,开展与克隆和治疗性克隆相关的基础研究/应用基础研究工作,致力于推动基础研究向临床应用的转化,通过联合实验室的工作促进中法双方在胚胎干细胞与发育生物学领域的合作,为人的治疗性克隆研究和人类疾病相关模型工作打好基础,为提高人类健康水平服务。国家新药筛选中心与美国
英杰公司开展合作研究中国科学院上海药物研究所国家新药筛选中心和美国英杰公司(Invitrogen)于近日宣布达成合作研究协议,计划涉及英杰公司的新药发现技术(如GeneBLAzerTM 和Polar ScreenTM)的合作应用和新的试剂及药物筛选方法的共同研究。这些方法和试剂将被应用于对国家新药筛选中心化合物样品库实施的针对核受体的高通量筛选中。
“很高兴能与国家新药筛选中心共同开发和运用基于细胞核受体的新型筛选方法及技术,核受体在一些疾病进程中的重要性及相关活性化合物的成药性已经得到证实。我们相信通过这次合作,英杰公司的试剂及技术在核受体小分子调节剂筛选方面的应用价值将得到验证”,英杰公司药物发现技术部主任John Printen表示,“希望不断地在新的平台中展示英杰生物技术的实用性及效率。国家新药筛选中心在天然产物及传统中草药研究方面的经验将帮助我们开拓药物研发技术的新领域。”
国家新药筛选中心主任王明伟说:“与英杰公司的合作是我们实施国际化战略进程的重要步骤和自然延伸。通过这次平等互利的合作,双方将在技术、资源和人力等方面达到最大程度的优势互补和整合强化”,“通过和英杰公司科学家们的紧密合作,我们相信可以很快地把一系列全新的、基于核受体的筛选方法引进验证,并应用到大规模药物筛选之中,由此发现的活性小分子化合物将把这项合作推向一个新阶段。”
禽流感病毒目前仍然比较稳定正在日内瓦参加“禽流感问题国际会议”的世界动物卫生组织总干事贝尔纳·瓦莱特日前表示,虽然禽流感对人类的威胁始终存在,但H5N1型禽流感病毒目前仍然比较稳定。
瓦莱特解释说,在亚洲两年来至少有数百万野鸟和家禽感染了H5N1型病毒,而通过养殖厂、田间、森林、实验室等,这些动物与人类接触的机会至少有数百万次,但两年来仅出现了123个人类感染禽流感的病例,此外该病毒与其他病毒混合的迹象也不明显,这些事实说明这种病毒感染人的效率还很低,它仍然比较稳定。瓦莱特表示,禽流感通过迁徙野鸟从东南亚传入东亚用了一年多时间,而从东亚再传入俄罗斯以及罗马尼亚又用了一年,这说明它的地域传染速度很慢,有可能是一些动物本身就有抗体抵御病毒,减弱了它的传播速度。瓦莱特表示,鉴于禽流感在鸟类中的传染速度不够快,也不够普遍,因此不能肯定鸟类或禽类一定会把这种病毒大量传染给人类,并引发流感大流行。当然我们仍然应该保持高度警惕。瓦莱特强调,“人类流感的大流行并非迫在眉睫或不可避免”,他认为,人们不应该把这种病毒对人的危害与对禽类的危害混淆。目前这种病毒传染给人的能力还很弱,因此当前把预防人类流感的工作放在首位是错误的,当务之急是集中精力在禽类中预防这种流感的蔓延,以避免遭受更大损失。瓦莱特说:“我对人类控制住该病毒的蔓延表示乐观。”
美国研制成功快速
检测流感毒株芯片美国最近研制成能在11小时内检测出流感病毒株系的芯片,这种芯片使用简便、检测结果快速准确,有望帮助人们应对可能发生的流感疫情。
美国科罗拉多大学化学系教授凯西·罗兰和罗伯特·库奇卡等人研制的这种“流感芯片”,目前已通过了美国疾病控制和预防中心的初步测试,有望在一年内投入实验室应用。对H5N1型高致病性禽流感和H1N1、H3N2两种人类常见流感,它的检测准确率达90%以上。
“流感芯片”和显微镜用的载物片一样大小,上面是整齐排列的微小点阵。每3个直径约50微米的小点排成一行,点上嵌的是代表流感病毒基因组一个特征基因的DNA材料,然后再按照已知流感病毒株系的基因组序列,将它们排成一列。一个这样的微小点阵代表一个已知的病毒株系,就可以用来检测样本中的病毒了。
快速检测流感病毒株系具有重要意义,它能帮助医务人员尽早发现新毒株、追踪病毒的演化、找出最危险的毒株并开发相应疫苗,在防控流感疫情时掌握主动。
研究人员表示,“流感芯片”所用的病毒基因组信息将免费提供给各实验室。他们计划进一步提高检测速度,并在未来几年内将整个系统做成掌上电脑大小,这样可以用于野外的快速实地检测。
酵母研究揭示出抗癌
药物的分子作用机理在一项新的研究中,酵母菌揭示出了一种能通过抑制血液供应来中止人类肿瘤生长的抗癌药物的分子作用机理。直到现在,开发药物GSAO的新南威尔士大学研究人员才知道它能杀死内皮细胞但对肿瘤本身无直接影响的原因。新的研究表明内皮细胞缺少一种肿瘤用于驱逐出入侵它的细胞结构的外源分子的“转运蛋白”。研究的结果发表在近日出版的Journalof the National Cancer Institute。
研究人员利用经过遗传修饰的酵母细胞来分析这种转运蛋白,他们使用了能代表基因组中每一个非核心基因的4 800个酵母突变。实验结果显示那些对药物GSAO敏感的突变酵母细胞缺少能让它们将药物驱逐出细胞膜的蛋白质。这些发现告诉我们有一个编码一种对细胞保护自己不被GSAO攻击至关重要的蛋白质的特殊基因。知道了这种蛋白后,研究人员在人体中发现了一种相对应的蛋白——多药物抗性相关蛋白(MRP)。
肿瘤中这种转运蛋白的存在是抗癌药物无法攻击癌症的其中一个原因。GSAO能通过攻击缺少这种转运蛋白的内皮细胞来间接靶向肿瘤。因此,GSAO的抗癌机制是阻止肿瘤生长扩散所依赖的血液供应。